Ottelut alkavat Eteläisessä lohkossa keskiviikkona, kun MPS ja VJS iskevät yhteen. Torstaina FC Rauma emännöi TuWea. Lohkon muut joukkueet aloittavat koitoksensa lauantaina, kun sarjanousija PKKU saa vastaansa KSF:n ja TiPS kohtaa Klubi 09:n.
Pohjoisen lohkon ottelut käynnistyvät sunnuntaina. Merilappi United ja HJS kohtaavat Kemissä ja FC Kuusysi matkustaa Jyväskylään JyPK:n vieraaksi. Ehkäpä lohkon kovimmat ennakkosuosikit Ilves ja VIFK iskevät heti yhteen Tampereella. Pohjoisen lohkon täydentää TJK, joka aloittaa kautensa vasta ensi viikolla, sillä Pohjoisessa lohkossa on vain seitsemän joukkue FC Sportin luovuttua sarjasta.
Naisten Ykkönen pelataan kahdessa alueellisessa kaksinkertaisessa alkusarjassa Tämän jälkeen joukkueet jakaantuvat valtakunnalliseen kahdeksan joukkueen ylempään, yksinkertaiseen jatkosarjaan, jossa pelaavat kummankin alkusarjalohkon neljä parasta joukkuetta. Lähtöpisteitä ylempään jatkosarjaan jaetaan alkusarjan sijoitusten perusteella 3-2-1-0. Jatkosarjan voittaja nousee suoraan Liigaan kaudelle 2014.
Ylemmän jatkosarjan ulkopuolelle jääneet joukkueet pelaavat kaksinkertaisen alemman loppusarjan oman lohkonsa joukkueiden kesken. Lähtöpisteitä alempaan jatkosarjaan jaetaan alkusarjan sijoitusten perusteella 3-2-1-0. Alemman jatkosarjan lohkojen kolmanneksi ja alemmaksi sijoittuneet joukkueet putoavat Naisten Kakkoseen seuraavaksi kaudeksi.
