Vuosikaudet Veikkausliigan pelaajaeliittiin kuulunut laituri palasi kaudeksi 2011 kotikonnuilleen ja oli suuressa roolissa johdattamassa JJK:ta seurahistorian ensimmäiseen Veikkausliiga-mitaliin ja sen myötä europeleihin. Manninen jäi kasvattiseuraansa myös sarjaportaan vaihduttua liigasta Ykköseen kauden 2013 päätteeksi ja onkin kuluvien kahden kauden ajan ollut sarjan ehdotonta parhaimmistoa.
JJK:ssa Manninen on viime vuosina ottanut edustusjoukkueen pelikenttien lisäksi yhä suurempaa roolia myös juniorien valmennuksessa ja nyt edessä on toinen kausi B-nuorten vastuuvalmentajana. Viime kauden päätteeksi Manninen valittiin ansaitusti JJK:ssa kauden parhaaksi pelaajaksi niin yleisessä äänestyksessä kuin kannattajienkin keskuudessa ja vaikka B-nuoret jäivät niukasti ulos SM-sarjasta, oltiin kettuväen keskuudessa vakuuttuneita myös valmentaja-Mannisen työnäytteestä B-junnujen peräsimessä.
Lähde: www.jjk.fi