Eteläisen lohkon ykkössija meni TiPS:lle, joka voitti lohkonsa neljän pisteen erolla ennen MPS:aa. VJS tuli kolme pistettä perässä kolmantena. Viimeisestä ylemmän jatkopaikan paikasta käytiin tiukkaa kamppailua päätöskierrokselle saakka. TuWen tasapeli FC Rauman kanssa piti turkulaiset raumalaisten edellä kahden pisteen erolla ja kun PKKU ei onnistunut kukistamaan omassa ottelussaan KSF:ia, niin TuWe meni ylempään jatkosarjaan. Klubi 09 jäi lohkossa viimeiseksi.
Eteläinen lohko
Pohjoisessa lohkossa käytiin tiukka kamppailu lohkovoitosta ja kolmesta lähtöpisteestä. Lohkovoiton nappasi Merilappi United, kun se voitti omassa päätöskierroksen ottelussaan HJS:n peräti 10-0 ja samanaikaisesti VIFK ja Ilves jäivät pistejakoon. Näin Merilappi United otti lohkon piikkipaikan kahden pisteen erolla VIFK:hon ja Ilvekseen. Neljäs ylemmän jatkolohkon paikka meni JyPK:lle. Sarjapaikastaan jäivät nyt taistelemaan TJK, FC Kuusysi sekä kaikki ottelunsa maalierolla 8-88 hävinnyt HJS.
Pohjoinen lohko
Yläjatkosarja pelataan yksinkertaisena sarjana jossa alkulohkon voittajat saavat kolme lähtöpistettä (TiPS, Merilappi United), kakkoset kaksi (MPS, VIFK), kolmoset yhden lähtöpisteen (VJS, Ilves) ja neloset (TuWe, JyPK) lähtevät pisteittä taistelemaan noususta Naisten Liigaan. Jatkosarjan voittaja nousee suoraan Liigaan kaudelle 2014.
Yläloppusarja
Alaloppusarja pelataan kahdessa lohkossa kaksinkertaisena sarjana. Lohko A:ssa on neljä joukkuetta ja B:ssä kolme. Ylemmän loppusarjan tavoin joukkueet saavat lähtöpisteitä alempaan loppusarjaan. A:ssa pisteet menivät FC Raumalle (3), PKKU:lle (2) ja KSF:lle (1). Klubi 09 joutuu lähtemään ilman pisteitä. Lohko B:ssä on mukana vain kolme joukkuetta: TJK, FC Kuusysi ja HJS.
Alemman jatkosarjan lohkojen kolmanneksi ja alemmaksi sijoittuneet joukkueet putoavat Naisten Kakkoseen seuraavaksi kaudeksi.
Alaloppusarja A
Alaloppusarja B