Cupin lohkovaiheessa ovat mukana kaudella 2016 Veikkausliigassa ja Ykkösessä pelanneet joukkueet, Ykkösen nousukarsintaan 2016 yltäneet joukkueet sekä neljä cupin alkukierroksilta tiensä jatkoon selvittänyttä joukkuetta.
Joukkueet on jaettu alueellisesti viiteen kuuden joukkueen lohkoon, joissa pelataan yksinkertainen sarja. Lohkojen voittajat pääsevät suoraan puolivälieriin. Lohkojen kakkoset sekä paras lohkokolmonen etenevät puolivälieräkarsintaan, jossa pelataan yksiosaiset ottelut ja niiden voittajat pääsevät puolivälieriin.
Lohkovaiheen ensimmäiset ottelut pelataan perjantaina 20. tammikuuta ja lohkovaihe saadaan päätökseen tiistaina 7. maaliskuuta pelattavien lohko E:n viimeisten otteluiden myötä.
Lohkovaiheen otteluohjelma kokonaisuudessaan Palloliiton Tulospalvelusivuilla.
